Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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RAB40BQ12829 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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RAB40BQ12829 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RAB40BQ12829 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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RAB40BQ12829 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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RAB40BQ12829 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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RAB40BQ12829 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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RAB40BQ12829 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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