Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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RIPK1Q13546 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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RIPK1Q13546 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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RIPK1Q13546 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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