Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN4PQ13434 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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MKRN4PQ13434 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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MKRN4PQ13434 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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MKRN4PQ13434 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN4PQ13434 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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