Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1H3Q13133 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1H3Q13133 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1H3Q13133 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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