Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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