Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPRDP23468 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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