Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC74AQ96AQ1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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