Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KRR1Q13601 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
KRR1Q13601 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
KRR1Q13601 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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