Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TOP3AQ13472 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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