Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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UBR3Q6ZT12 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
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UBR3Q6ZT12 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.83□□□□□ -2.86
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UBR3Q6ZT12 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
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UBR3Q6ZT12 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
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UBR3Q6ZT12 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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UBR3Q6ZT12 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
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UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
UBR3Q6ZT12 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
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