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Protein–RNA interactions for Protein: Q13277
STX3, Syntaxin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
STX3
Q13277
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
MIR1302-2-201
ENST00000607096
138 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.5-201
ENST00000362334
102 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.176-201
ENST00000363815
109 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-978P-201
ENST00000364371
103 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.328-201
ENST00000365208
113 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.342-201
ENST00000365352
113 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-472P-201
ENST00000384299
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-24P-201
ENST00000384440
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-976P-201
ENST00000516086
111 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
AC009779.6-201
ENST00000603972
165 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Evf-2_5p.1-201
ENST00000614213
142 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-337P-201
ENST00000391243
106 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNY1P9-201
ENST00000532431
109 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU2-4P-201
ENST00000606190
192 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.154-201
ENST00000363624
102 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-728P-201
ENST00000365375
104 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
MTATP6P23-201
ENST00000440153
476 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Z83846.1-201
ENST00000446798
265 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
AC090574.1-201
ENST00000623186
233 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
MIR624-201
ENST00000385217
97 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6ATAC41P-201
ENST00000408600
126 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.596-201
ENST00000410462
109 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU4-43P-201
ENST00000410628
137 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
SNORD116-25-201
ENST00000516517
92 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
SNORD114-15-201
ENST00000364687
72 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
SNORD114-17-201
ENST00000364699
75 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.357-201
ENST00000365487
109 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
RNU7-2P-201
ENST00000516096
62 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
AC107958.3-201
ENST00000553410
431 nt
TSL 3
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
MIR6773-201
ENST00000612812
74 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
STX3
Q13277
Y_RNA.68-201
ENST00000362881
102 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-35P-201
ENST00000384530
107 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIRLET7B-201
ENST00000385140
83 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MT-TL1-201
ENST00000386347
75 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU4-69P-201
ENST00000410677
143 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU7-134P-201
ENST00000458997
64 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
SNORD2-201
ENST00000459163
69 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
SNORD18.2-201
ENST00000459604
70 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNA5SP236-201
ENST00000516169
116 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
AL442663.2-201
ENST00000554385
511 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
AC073869.6-201
ENST00000640656
341 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MT-ATP8-201
ENST00000361851
207 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.28-201
ENST00000362554
111 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
snoU2_19.2-201
ENST00000363024
80 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR34C-201
ENST00000384831
77 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
FGF7P6-202
ENST00000451282
293 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
SNORD42B-201
ENST00000458893
67 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-277P-201
ENST00000516272
106 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
CR383656.11-201
ENST00000552261
498 nt
TSL 3
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.318-201
ENST00000365131
97 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-1289P-201
ENST00000384431
106 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR124-2-201
ENST00000385081
109 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-588P-201
ENST00000410281
105 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RRM2B-207
ENST00000519962
201 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR4464-201
ENST00000580818
92 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
KCNQ1OT1_5.1-201
ENST00000621902
226 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.64-201
ENST00000362845
102 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-876P-201
ENST00000391295
104 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
snoU83B.1-201
ENST00000517136
88 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR548AX-201
ENST00000580117
73 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.31-201
ENST00000362574
102 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-1254P-201
ENST00000391266
104 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
AC138393.2-201
ENST00000414742
246 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.76-201
ENST00000362931
109 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.299-201
ENST00000364973
94 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-616P-201
ENST00000384353
107 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-121P-201
ENST00000410525
99 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU7-123P-201
ENST00000515911
60 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
RNU6-479P-201
ENST00000516348
105 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
Y_RNA.275-201
ENST00000364726
110 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
AC068339.1-201
ENST00000526965
141 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
MIR3115-201
ENST00000577915
68 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
STX3
Q13277
SNORD27-201
ENST00000363981
72 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
RNU6-381P-201
ENST00000391259
108 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
TTC28-AS1_2.1-201
ENST00000611117
157 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
Y_RNA.52-201
ENST00000362760
96 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
RNU6-690P-201
ENST00000365242
106 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
IGHVII-40-1-201
ENST00000517316
58 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
AC026421.1-201
ENST00000519101
163 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
MIR1302-1-201
ENST00000637932
143 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
RNU6-10P-201
ENST00000384036
107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
MIR1252-201
ENST00000408861
65 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
STX3
Q13277
SNORD19B-201
ENST00000459623
84 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
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