Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VWA3AA6NCI4 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VWA3AA6NCI4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VWA3AA6NCI4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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