Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NCOA1Q15788 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
NCOA1Q15788 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
NCOA1Q15788 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms