Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN4PQ13434 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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