Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SCN5AQ14524 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms