Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM28Q13263 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM28Q13263 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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