Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNF235Q14590 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms