Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMT12Q53H54 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMT12Q53H54 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms