Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.3 ms