Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.8 ms