Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPREP23469 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPREP23469 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPREP23469 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPREP23469 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPREP23469 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPREP23469 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPREP23469 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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