Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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