Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TM6SF1Q9BZW5 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms