Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RNF20Q5VTR2 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RNF20Q5VTR2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RNF20Q5VTR2 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RNF20Q5VTR2 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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