Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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