Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NFE2Q16621 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms