Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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RABGEF1Q9UJ41 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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RABGEF1Q9UJ41 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RABGEF1Q9UJ41 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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