Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNX17Q15036 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNX17Q15036 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNX17Q15036 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SNX17Q15036 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SNX17Q15036 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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