Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDE3BQ13370 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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