Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.1 ms