Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXD4Q12950 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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