Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.7 ms