Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms