Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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