Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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DDB1Q16531 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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DDB1Q16531 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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DDB1Q16531 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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DDB1Q16531 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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DDB1Q16531 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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DDB1Q16531 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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