Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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