Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.4 ms