Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TM6SF1Q9BZW5 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms