Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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