Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM63Q969Q1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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