Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms