Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TM6SF1Q9BZW5 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms