Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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