Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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TRIM63Q969Q1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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TRIM63Q969Q1 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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TRIM63Q969Q1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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