Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GRIK3Q13003 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GRIK3Q13003 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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GRIK3Q13003 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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