Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms