Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KRW8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KRW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms