Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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