Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KLF9Q13886 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KLF9Q13886 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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