Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms